除了重建工程的争议，巴生观音亭是否该列为历史古迹，也备受关注。观音亭理事会已明确表态，要争取列为旅游景点，却拒绝宪报列为历史古迹。

1998年，当年的巴生观音亭理事会抱着患得患失心理，讨论是否接纳将观音亭列入历史古迹，将土地管理权交予博物馆。

理事会无法定夺，发出通知信邀请17个乡团的代表一起开会，最后一致决定反对；理由是以(1)博物馆章程内容所涉及的权限范围对该亭不利及(2)观音亭具有100多年历史，由巴生17个乡团组成的理事会有能力重新装修及保留它。

5年后，观音亭再次面对保留与重建的问题，遂有人重提将观音亭列入历史古迹的建议。

许天顺说，当年巴生国会议员拿汀巴杜卡陈仪乔博士提出的这项建议，经17个乡团开会一致否决。如果如今有正式书信再重提建议，将再开会讨论。

林钦耀则清楚地指出，观音亭是巴生历史悠久的庙宇，是由巴生华人乡团共同管理，是巴生人共同的信仰；而华人乡团有能力解决维修巴生观音亭的经费。

“因为，巴生有数百间华人神庙，但是巴生五条路观音亭却是独一无二。”

但是，在发展的列车中，没有宪报为历史古迹的保障，若未来政府需征用观音亭的地段该如何?毕竟，当年政府就征用观音亭部份土地，建设一条大道。

林钦耀无奈地说，巴生观音亭在重建及美化后，将争取列为旅游景点，并盼政府能保留不会改变它，可是却拒绝宪报列为历史古迹。他也说,“观音亭的信徒人数众多，如果将观音亭列入历史古迹，保留原庙，如何容纳这么多信众膜拜?因为，我们都很喜欢观音亭，我们都希望见到观音亭发展更好，这是巴生华人共同拥有的资产，我们不希望交给博物馆管理。”